Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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