Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
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TNFAIP1Q13829 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
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TNFAIP1Q13829 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
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TNFAIP1Q13829 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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TNFAIP1Q13829 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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TNFAIP1Q13829 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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TNFAIP1Q13829 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
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TNFAIP1Q13829 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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TNFAIP1Q13829 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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TNFAIP1Q13829 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFAIP1Q13829 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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