Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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TUBA3CQ13748 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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TUBA3CQ13748 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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TUBA3CQ13748 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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TUBA3CQ13748 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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