Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSTA3Q13630 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSTA3Q13630 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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