Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD4Q13485 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD4Q13485 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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