Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMS2P3Q13401 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P3Q13401 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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