Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE3BQ13370 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
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