Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGCGQ13326 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCGQ13326 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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