Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SLAMF1Q13291 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLAMF1Q13291 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms