Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RESTQ13127 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RESTQ13127 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RESTQ13127 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RESTQ13127 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RESTQ13127 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RESTQ13127 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RESTQ13127 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RESTQ13127 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RESTQ13127 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RESTQ13127 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RESTQ13127 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RESTQ13127 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RESTQ13127 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RESTQ13127 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RESTQ13127 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RESTQ13127 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RESTQ13127 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RESTQ13127 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RESTQ13127 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RESTQ13127 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RESTQ13127 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RESTQ13127 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RESTQ13127 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RESTQ13127 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RESTQ13127 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RESTQ13127 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RESTQ13127 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RESTQ13127 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RESTQ13127 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RESTQ13127 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RESTQ13127 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RESTQ13127 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RESTQ13127 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RESTQ13127 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RESTQ13127 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RESTQ13127 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RESTQ13127 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RESTQ13127 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RESTQ13127 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RESTQ13127 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RESTQ13127 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RESTQ13127 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RESTQ13127 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RESTQ13127 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RESTQ13127 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RESTQ13127 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RESTQ13127 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RESTQ13127 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RESTQ13127 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RESTQ13127 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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