Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXC1Q12948 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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FOXC1Q12948 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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FOXC1Q12948 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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FOXC1Q12948 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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FOXC1Q12948 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXC1Q12948 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXC1Q12948 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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