Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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