Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BPTFQ12830 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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