Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 RPC17YJL011C 486 nt5.15□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 RUF20RUF20 443 nt5.15□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 snR17bsnR17b 332 nt5.15□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 CSH1YBR161W 1131 nt5.15□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 OAF1YAL051W 3144 nt5.15□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 SSB1YDL229W 1842 nt5.15□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 SSB2YNL209W 1842 nt5.15□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 IZH3YLR023C 1632 nt5.15□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 RVB1YDR190C 1392 nt5.15□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 RRB1YMR131C 1536 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YDL012CYDL012C 324 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 HIM1YDR317W 1245 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 NPY1YGL067W 1155 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 FRA2YGL220W 363 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 DAM1YGR113W 1032 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YNL057WYNL057W 333 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 MPD1YOR288C 957 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YBR134WYBR134W 402 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 SSA2YLL024C 1920 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 GSY1YFR015C 2127 nt5.14□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 HOM3YER052C 1584 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 SNA2YDR525W-A 240 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 CUP1-1YHR053C 186 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 CUP1-2YHR055C 186 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 COA3YJL062W-A 258 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 RFC2YJR068W 1062 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 CMC1YKL137W 336 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 ACP1YKL192C 378 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 ORM2YLR350W 651 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 TAF3YPL011C 1062 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 CBP6YBR120C 489 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 SAD1YFR005C 1347 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 PSY4YBL046W 1326 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 PMT4YJR143C 2289 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 PUS9YDL036C 1389 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 CDC15YAR019C 2925 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 AXL2YIL140W 2472 nt5.13□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 RTC5YOR118W 1704 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 TRM44YPL030W 1704 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 AVT1YJR001W 1809 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 KRE28YDR532C 1158 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YGL199CYGL199C 471 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 SDT1YGL224C 843 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YLR049CYLR049C 1287 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YMR315WYMR315W 1050 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YBL077WYBL077W 432 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 REX4YOL080C 870 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YOR097CYOR097C 528 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 SFG1YOR315W 1041 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 MUM2YBR057C 1101 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 SLS1YLR139C 1932 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 CEG1YGL130W 1380 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 POL12YBL035C 2118 nt5.12□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 RCK2YLR248W 1833 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YND1YER005W 1893 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 ARG82YDR173C 1068 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 CBS2YDR197W 1170 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YDR290WYDR290W 330 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YEA4YEL004W 1029 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YKL071WYKL071W 771 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YAR061WYAR061W 204 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 RRN9YMR270C 1098 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 PBP2YBR233W 1242 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 SYP1YCR030C 2613 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 HMS1YOR032C 1305 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 ALG1YBR110W 1350 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 GAD1YMR250W 1758 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 TYW1YPL207W 2433 nt5.11□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 SKG3YLR187W 3081 nt5.1□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 DAS2YDR020C 699 nt5.1□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 LST7YGR057C 729 nt5.1□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 ELO3YLR372W 1038 nt5.1□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 GAB1YLR459W 1185 nt5.1□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 END3YNL084C 1050 nt5.1□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 ALG9YNL219C 1668 nt5.1□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 GRX5YPL059W 453 nt5.1□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YPL278CYPL278C 303 nt5.1□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YPS7YDR349C 1791 nt5.09□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 RAD28YDR030C 1521 nt5.09□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 TAF10YDR167W 621 nt5.09□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.09□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 TTI2YJR136C 1266 nt5.09□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 ICY2YPL250C 411 nt5.09□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 YPR142CYPR142C 564 nt5.09□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 GRX1YCL035C 333 nt5.09□□□□□ -1.59
CLF1Q12309 PRP28YDR243C 1767 nt5.09□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 MSC2YDR205W 2175 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 GAS4YOL132W 1416 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 IKS1YJL057C 2004 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 BUD30YDL151C 582 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YIL165CYIL165C 360 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YAR023CYAR023C 540 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YLR271WYLR271W 825 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 SPC2YML055W 537 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 AKL1YBR059C 3327 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 PBI1YPL272C 1554 nt5.08□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 MNN4YKL201C 3537 nt5.07□□□□□ -1.6
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