Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 APE2YKL157W 2859 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 MNL1YHR204W 2391 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 EKI1YDR147W 1605 nt4.54□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YTM1YOR272W 1383 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 AZR1YGR224W 1842 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 SNF2YOR290C 5112 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YDL109CYDL109C 1944 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YLR125WYLR125W 411 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 ANT1YPR128C 987 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 LDB17YDL146W 1476 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 PMT5YDL093W 2232 nt4.53□□□□□ -1.68
LSP1Q12230 NUP133YKR082W 3474 nt4.52□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 HCM1YCR065W 1695 nt4.52□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.52□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 GVP36YIL041W 981 nt4.52□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YJR038CYJR038C 363 nt4.52□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 SPS19YNL202W 879 nt4.52□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 VPS28YPL065W 729 nt4.52□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 UBC1YDR177W 648 nt4.51□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 AAD10YJR155W 867 nt4.51□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 IDP2YLR174W 1239 nt4.51□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 ORM2YLR350W 651 nt4.51□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt4.51□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 GPI2YPL076W 843 nt4.51□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 PET20YPL159C 762 nt4.51□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 LYS2YBR115C 4179 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 PRM7YDL039C 2097 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 ABD1YBR236C 1311 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 HMG1YML075C 3165 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 GRX6YDL010W 696 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 RPS13YDR064W 456 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 NSE3YDR288W 912 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 MAG1YER142C 891 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 TIM21YGR033C 720 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 DAN1YJR150C 897 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 RPS0BYLR048W 759 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YLR326WYLR326W 723 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 BLS1YLR408C 369 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YMR082CYMR082C 357 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 LTO1YNL260C 597 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 MET16YPR167C 786 nt4.5□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 RSC3YDR303C 2658 nt4.49□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 RXT3YDL076C 885 nt4.49□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 DIN7YDR263C 1293 nt4.49□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 SEC53YFL045C 765 nt4.49□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 MRT4YKL009W 711 nt4.49□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YSA1YBR111C 696 nt4.49□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 SEO1YAL067C 1782 nt4.49□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 GIP4YAL031C 2283 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 MCM2YBL023C 2607 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 SPT6YGR116W 4356 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 PRP19YLL036C 1512 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YBR139WYBR139W 1527 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 SAY1YGR263C 1275 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 AIR1YIL079C 1083 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 HIS5YIL116W 1158 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 PRM9YAR031W 897 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 SAS10YDL153C 1833 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 FAR8YMR029C 1572 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YPK3YBR028C 1578 nt4.48□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 MUP3YHL036W 1641 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YDL228CYDL228C 642 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 SCL1YGL011C 759 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YGR051CYGR051C 324 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YLR036CYLR036C 612 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 RFU1YLR073C 603 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YLR156WYLR156W 345 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YLR159WYLR159W 345 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 YLR161WYLR161W 345 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 EOS1YNL080C 1101 nt4.47□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 GCN5YGR252W 1320 nt4.46□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 CUS1YMR240C 1311 nt4.46□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 ELM1YKL048C 1923 nt4.46□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 USA1YML029W 2517 nt4.46□□□□□ -1.69
LSP1Q12230 CWH43YCR017C 2862 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 FMP25YLR077W 1752 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 YHL012WYHL012W 1482 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 MRPL7YDR237W 879 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 YDR282CYDR282C 1245 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 KRE28YDR532C 1158 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 YIL152WYIL152W 708 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 YLR225CYLR225C 1224 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 OSW1YOR255W 837 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 OAF1YAL051W 3144 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 YOR022CYOR022C 2148 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 TAF12YDR145W 1620 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 CLB5YPR120C 1308 nt4.46□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 SKM1YOL113W 1968 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 SWI1YPL016W 3945 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 GAS2YLR343W 1668 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 RAD57YDR004W 1383 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 RPP1AYDL081C 321 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 AIM7YDR063W 450 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 MRP13YGR084C 1020 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 YKR047WYKR047W 306 nt4.45□□□□□ -1.7
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