Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD3Q0VAK6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD3Q0VAK6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms