Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYCNQ0VAF6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYCNQ0VAF6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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