Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF543Q08ER8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms