Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM27E3Q08E93 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms