Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PUDPQ08623 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms