Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKAP4Q07065 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms