Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7AQ04656 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms