Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPEQ02224 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPEQ02224 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms