Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A2Q02221 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A2Q02221 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A2Q02221 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX6A2Q02221 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A2Q02221 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX6A2Q02221 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A2Q02221 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A2Q02221 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A2Q02221 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A2Q02221 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms