Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD4Q01804 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms