Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms