Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLTCQ00610 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLTCQ00610 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLTCQ00610 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms