Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK17Q00537 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK17Q00537 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms