Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK6Q00534 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms