Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDKL1Q00532 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms