Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRX4P78413 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX4P78413 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX4P78413 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX4P78413 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX4P78413 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX4P78413 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX4P78413 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX4P78413 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX4P78413 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX4P78413 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX4P78413 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX4P78413 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX4P78413 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX4P78413 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX4P78413 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX4P78413 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX4P78413 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX4P78413 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX4P78413 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms