Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOMO3P69849 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms