Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM4P67936 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM4P67936 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM4P67936 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM4P67936 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM4P67936 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM4P67936 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPM4P67936 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPM4P67936 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM4P67936 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM4P67936 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM4P67936 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM4P67936 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM4P67936 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM4P67936 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM4P67936 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TPM4P67936 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM4P67936 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM4P67936 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM4P67936 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM4P67936 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPM4P67936 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM4P67936 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM4P67936 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM4P67936 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM4P67936 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM4P67936 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM4P67936 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM4P67936 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM4P67936 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM4P67936 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPM4P67936 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM4P67936 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM4P67936 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM4P67936 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM4P67936 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM4P67936 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM4P67936 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM4P67936 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM4P67936 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM4P67936 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPM4P67936 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPM4P67936 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPM4P67936 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM4P67936 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM4P67936 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM4P67936 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM4P67936 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM4P67936 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM4P67936 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM4P67936 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM4P67936 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM4P67936 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM4P67936 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPM4P67936 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms