Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P61574 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P61574 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms