Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK11-1P61568 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms