Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS2P61201 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS2P61201 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS2P61201 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS2P61201 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS2P61201 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS2P61201 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS2P61201 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS2P61201 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS2P61201 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS2P61201 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS2P61201 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS2P61201 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS2P61201 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS2P61201 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS2P61201 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS2P61201 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS2P61201 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS2P61201 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS2P61201 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS2P61201 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS2P61201 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS2P61201 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS2P61201 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS2P61201 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS2P61201 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS2P61201 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS2P61201 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms