Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR1AP61163 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR1AP61163 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR1AP61163 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTR1AP61163 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTR1AP61163 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1AP61163 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1AP61163 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1AP61163 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1AP61163 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1AP61163 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR1AP61163 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR1AP61163 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms