Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3EP60228 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms