Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP11P59045 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP11P59045 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP11P59045 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP11P59045 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP11P59045 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP11P59045 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP11P59045 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP11P59045 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms