Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLF3P57682 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF3P57682 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLF3P57682 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLF3P57682 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF3P57682 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF3P57682 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF3P57682 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF3P57682 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF3P57682 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF3P57682 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF3P57682 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF3P57682 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF3P57682 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLF3P57682 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF3P57682 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF3P57682 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms