Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FCGRTP55899 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FCGRTP55899 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FCGRTP55899 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms