Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP7P55210 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP7P55210 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP7P55210 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP7P55210 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP7P55210 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP7P55210 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP7P55210 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP7P55210 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP7P55210 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP7P55210 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP7P55210 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP7P55210 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP7P55210 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP7P55210 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP7P55210 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP7P55210 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP7P55210 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP7P55210 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP7P55210 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CASP7P55210 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CASP7P55210 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CASP7P55210 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CASP7P55210 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP7P55210 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP7P55210 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP7P55210 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP7P55210 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP7P55210 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP7P55210 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP7P55210 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP7P55210 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP7P55210 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP7P55210 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CASP7P55210 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP7P55210 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CASP7P55210 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CASP7P55210 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP7P55210 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP7P55210 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms