Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELLP55199 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELLP55199 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELLP55199 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELLP55199 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELLP55199 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELLP55199 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELLP55199 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELLP55199 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELLP55199 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELLP55199 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELLP55199 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELLP55199 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELLP55199 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELLP55199 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELLP55199 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELLP55199 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELLP55199 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELLP55199 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELLP55199 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELLP55199 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELLP55199 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELLP55199 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELLP55199 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELLP55199 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELLP55199 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELLP55199 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELLP55199 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms