Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1LP55160 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1LP55160 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1LP55160 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1LP55160 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKAP1LP55160 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKAP1LP55160 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms