Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D1P54289 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms