Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN1P54253 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms