Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP2S1P53680 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms