Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACLYP53396 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ACLYP53396 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ACLYP53396 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACLYP53396 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACLYP53396 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACLYP53396 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACLYP53396 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACLYP53396 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACLYP53396 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACLYP53396 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACLYP53396 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACLYP53396 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACLYP53396 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACLYP53396 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACLYP53396 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACLYP53396 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ACLYP53396 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACLYP53396 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACLYP53396 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACLYP53396 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACLYP53396 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACLYP53396 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACLYP53396 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACLYP53396 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACLYP53396 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACLYP53396 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACLYP53396 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACLYP53396 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACLYP53396 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACLYP53396 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACLYP53396 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACLYP53396 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ACLYP53396 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACLYP53396 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACLYP53396 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACLYP53396 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACLYP53396 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACLYP53396 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACLYP53396 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACLYP53396 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACLYP53396 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACLYP53396 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACLYP53396 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms