Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THOP1P52888 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THOP1P52888 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THOP1P52888 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THOP1P52888 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THOP1P52888 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THOP1P52888 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THOP1P52888 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THOP1P52888 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THOP1P52888 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THOP1P52888 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THOP1P52888 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THOP1P52888 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THOP1P52888 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THOP1P52888 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THOP1P52888 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THOP1P52888 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THOP1P52888 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THOP1P52888 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THOP1P52888 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THOP1P52888 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THOP1P52888 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THOP1P52888 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms