Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSRP3P50461 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms